Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cpne7Q0VE82 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne7Q0VE82 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms