Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Lrriq1Q0P5X1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lrriq1Q0P5X1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lrriq1Q0P5X1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lrriq1Q0P5X1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms