Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r181Q0P547 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms