Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf541Q0GGX2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Znf541Q0GGX2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Znf541Q0GGX2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms