Protein–RNA interactions for Protein: Q09014

Ncf1, Neutrophil cytosol factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncf1Q09014 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncf1Q09014 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncf1Q09014 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms