Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp2Q08652 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp2Q08652 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms