Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxc4Q08624 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc4Q08624 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc4Q08624 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms