Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MestQ07646 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MestQ07646 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MestQ07646 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MestQ07646 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MestQ07646 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MestQ07646 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MestQ07646 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MestQ07646 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MestQ07646 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MestQ07646 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MestQ07646 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MestQ07646 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MestQ07646 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MestQ07646 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MestQ07646 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MestQ07646 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MestQ07646 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms