Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Fmn1Q05860 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fmn1Q05860 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fmn1Q05860 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms