Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms