Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdk16Q04735 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk16Q04735 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdk16Q04735 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms