Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nf1Q04690 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nf1Q04690 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nf1Q04690 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nf1Q04690 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nf1Q04690 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Nf1Q04690 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Nf1Q04690 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nf1Q04690 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nf1Q04690 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nf1Q04690 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nf1Q04690 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nf1Q04690 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nf1Q04690 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nf1Q04690 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nf1Q04690 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nf1Q04690 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nf1Q04690 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nf1Q04690 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nf1Q04690 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nf1Q04690 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms