Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smpd1Q04519 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smpd1Q04519 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smpd1Q04519 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms