Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Kcnb1Q03717 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kcnb1Q03717 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kcnb1Q03717 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms