Protein–RNA interactions for Protein: Q03141

Mark3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark3Q03141 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Mark3Q03141 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mark3Q03141 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms