Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NfiaQ02780 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NfiaQ02780 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NfiaQ02780 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NfiaQ02780 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NfiaQ02780 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NfiaQ02780 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NfiaQ02780 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NfiaQ02780 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NfiaQ02780 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfiaQ02780 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfiaQ02780 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NfiaQ02780 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfiaQ02780 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NfiaQ02780 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfiaQ02780 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NfiaQ02780 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfiaQ02780 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NfiaQ02780 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfiaQ02780 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NfiaQ02780 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfiaQ02780 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfiaQ02780 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfiaQ02780 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms