Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snai1Q02085 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snai1Q02085 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snai1Q02085 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms