Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ascl1Q02067 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms