Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VcpQ01853 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VcpQ01853 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VcpQ01853 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VcpQ01853 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VcpQ01853 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VcpQ01853 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms