Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxd1Q01822 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxd1Q01822 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms