Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms