Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Top2aQ01320 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Top2aQ01320 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Top2aQ01320 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Top2aQ01320 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms