Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp4Q00724 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms