Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itga4Q00651 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Itga4Q00651 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms