Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GabpaQ00422 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms