Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cds1P98191 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds1P98191 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds1P98191 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds1P98191 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cds1P98191 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms