Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba2P98084 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba2P98084 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba2P98084 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba2P98084 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba2P98084 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Apba2P98084 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba2P98084 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba2P98084 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba2P98084 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba2P98084 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba2P98084 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apba2P98084 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba2P98084 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Apba2P98084 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms