Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Shc1P98083 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Shc1P98083 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms