Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cry1P97784 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cry1P97784 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cry1P97784 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cry1P97784 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms