Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Smarcc1P97496 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms