Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4cP97470 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppp4cP97470 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms