Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nbr1P97432 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nbr1P97432 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nbr1P97432 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms