Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atp1b3P97370 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp1b3P97370 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp1b3P97370 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms