Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis3P97368 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meis3P97368 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meis3P97368 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms