Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SgcaP82350 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SgcaP82350 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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