Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf11P70378 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf11P70378 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf11P70378 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms