Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ufd1P70362 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ufd1P70362 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms