Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smad1P70340 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smad1P70340 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smad1P70340 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms