Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pdlim4P70271 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdlim4P70271 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms