Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Traf5P70191 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Traf5P70191 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf5P70191 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf5P70191 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Traf5P70191 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms