Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acta1P68134 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta1P68134 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta1P68134 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta1P68134 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta1P68134 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Acta1P68134 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms