Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RhobP62746 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RhobP62746 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RhobP62746 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RhobP62746 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RhobP62746 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RhobP62746 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms