Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lsm5P62322 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms