Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vbp1P61759 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms