Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ube2kP61087 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ube2kP61087 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms