Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps5P59438 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps5P59438 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps5P59438 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps5P59438 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hps5P59438 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hps5P59438 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hps5P59438 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Hps5P59438 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hps5P59438 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hps5P59438 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Hps5P59438 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hps5P59438 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps5P59438 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hps5P59438 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hps5P59438 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps5P59438 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps5P59438 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps5P59438 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps5P59438 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps5P59438 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hps5P59438 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hps5P59438 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps5P59438 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hps5P59438 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hps5P59438 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hps5P59438 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps5P59438 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps5P59438 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hps5P59438 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hps5P59438 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hps5P59438 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms