Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup43P59235 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nup43P59235 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nup43P59235 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup43P59235 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup43P59235 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nup43P59235 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms