Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Scarf2P59222 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scarf2P59222 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms