Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp25P57080 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp25P57080 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp25P57080 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp25P57080 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp25P57080 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Usp25P57080 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp25P57080 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms