Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gp1bbP56400 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gp1bbP56400 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms